Hjernestammen danner fortsættelsen af rygmarven op i hjernen.

Man kan inddele hjernestammen kaudalt fra i medulla oblongata, pons, mesencephalon og diencephalon (diencephalon regnes som regel ikke med til hjernestammen, men i stedet til Storehjernen).

Fra hjernestammen udgår 11 af de 12 hjernenerver (den 1. hjernenerve udgår ikke fra hjernestammen). Hjernenervekernerne sidder også i hjernestammen. Mellem hjernenervekernerne sidder også retikulærsubstansen (formatio reticularis) der er en uskarpt afgrænsende gruppe af neuroner som ligger mellem hjernenervekernerne i hjernestammen. Nogen neurongrupper styrer cirkulation og åndedræt, andre søvn og vågenhed og andre øjenbevægelser.

Hjernestammen indeholder nogle hulrum med væske i, der kaldes ventrikler.

Sidst opdateret 19. maj 2023